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Dans les fonds rocheux, les grottes sous-marines constituent des sites privilégiés pour la plongée et l'exploration sous-marine, car elles renferment souvent des biotopes tout à fait particuliers.
L'entrée présente souvent un peuplement dense de zoanthaires (petites anémones ). Dans la partie moyenne et vers le fond, ou dans les grottes plus profondes, les éponges et les madrépores dominent sur les parois très colorées.

En raison de la diminution de l'intensité lumineuse et de l'agitation, l'intérieur des grottes permet également d'observer des espèces distribuées généralement plus profondément.
Par ailleurs, de nombreux poissons (mérou, congre) ou crustacés (cigales de mer) y trouvent souvent abri.

Certaines grottes sous-marines sont mondialement célèbres, comme la grotte Cosquer par exemple, pour les trésors archéologiques qu'elles renferment.
Néanmoins, aventuriers amateurs, toute aventure spéléologique présente des risques importants. Même l'exploration d'une anfractuosité en apparence anodine peut s'avérer dangereuse: se coincer dans un passage étroit ou perdre son chemin dans la bifurcation d'un boyau sont des risques à ne pass exclure. En plongée dans une grotte inconnue, il convient de ne pas perdre de vue la sortie.
Pour les passionnés de grottes sous-marines, il existe des clubs spécialisés.

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