De nombreux facteurs naturels ou liés à l’exploitation des mers par l’homme peuvent constituer une source de dangers pour le plongeur. Une bonne connaissance du milieu marin et une conduite prudente pendant l’immersion permettent de s’en préserver.
La mer est capricieuse et parfois violente : les mouvements du milieu marin jouent un rôle essentiel sur les conditions de la plongée. Mais, outre les animaux et la flore venimeux ou vénéneux, les dangers peuvent aussi être d’ordre géographique, selon les lieux choisis et leur configuration.

Les vagues :
Une mer agitée est source de problèmes tant pour la mise à l’eau que pour la sortie. De plus, elle prédispose au mal de mer...
Quand les vagues sont déferlantes avec formation de rouleaux, il est déconseillé de plonger. Néanmoins, dans le cas d'une plongée, les plongeurs devront se diviser en petites palanquées pour rester plus facilement groupés. Il sera indispensable de garder les palmes et de continuer à respirer avec le détendeur jusqu'au retour sur le bateau.
Côté sécurité en surface, en cas de mauvaise mer, il est nécessaire de redoubler d'attention: le repérage des plongeurs est toujours plus difficile par gros temps.

Le courant :
La présence de courants rend systématiquement la plongée plus fatigante et plus dangereuse.
Il est indispensable de vérifier s’il en existe sur le lieu de plongée. Pour cela, un test simple consiste à jeter un pendeur à l’eau, une fois le bateau stabilisé. Si le bout reste vertical, il n’y a pas ou peu de courant.
Il ne faut pas hésiter à annuler la plongée s’il estime que les conditions ne sont pas favorables.

Le manque de visibilité :
La plongée par faible visibilité prédispose à l’angoisse chez les débutants et rend la communication beaucoup plus difficile. La palanquée devra alors rester bien groupée et les plongeurs ne pas se perdre de vue les uns des autres.

Les rochers :
La forme particulière et la texture de certains rochers les rendent coupants. La peau ramollie par l'eau est naturellement fragilisée. Le port des gants lors d'une plongée est donc indispensable.
C'est également une bonne précaution contre les risques de piqûres de certains animaux en apparence inoffensifs. En effet, de nombreuses formes d'apparence rocheuses sont en réalité des animaux encroûtants (spongiaires ou coraux notamment) dont certains peuvent être urticants.

Les grottes :
Toute aventure spéléologique présente des risques importants. Même l'exploration d'une anfractuosité en apparence anodine peut s'avérer dangereuse: se coincer dans un passage étroit ou perdre son chemin dans la bifurcation d'un boyau sont des risques à ne pass exclure.
En plongée dans une grotte inconnue, il convient de ne pas perdre de vue la sortie.
Pour les passionnés de grottes sous-marines, il existe des clubs spécialisés.

Les algues :
Les grandes algues que l’on rencontre en Bretagne ou sur la côte Pacifique des Etats-Unis, comme par exemple le kelp, peuvent présenter un certain danger en gênant l’évolution des plongeurs. De plus, la visibilité étant réduite, il peut devenir difficile de se repérer et fréquent de perdre son orientation.
Dans ce cas, il ne faut pas lutter mais se laisser porter par leurs mouvements. En glissant dans le sens du courant il sera plus aisé de s’en dégager.

Les filets :
Les lignes de pêche, les filets oubliés ou abandonnés sont de réels pièges pour les plongeurs qui risquent de s’y coincer.
Inutile de se débattre, la situation ne ferait qu’empirer. La seule solution : avoir un couteau!

Les épaves :
L’exploration des épaves fait partie des plaisirs de la plongée en scaphandre. Néanmoins, il convient de prendre certaines précautions : attention aux tôles sont parfois très coupantes, mais surtout, il vaut mieux éviter de visiter certaines épaves exigües, et de TOUJOURS vérifier les possibilités de sorties.
De même, attention aux risques d’effondrements des structures fragilisées par la corrosion. Ce danger est réel.

Les hélices de bateau :
Bien que la propagation du son soit bien meilleure sous l’eau, la llocalisation reste néanmoins imprécise.
En remontant vers la surface, toujours faire un tour d’horizon afin de vérifier qu’il n’y a aucun obstacle.

Les engins explosifs :
Sur des sites ayant connu des batailles navales ou près des côtes de débarquement, il est encore possible de découvrir des munitions englouties.
Il convient alors de signaler immédiatement leur existence et leur emplacement à la gendarmerie de la localité.
Ne jamais essayer de manipuler un objet suspect, même abîmé par la corrosion, les risques d’explosion perdurent.