En 1950, le commandant arme l'ex-dragueur de mines Calypso avec lequel il a mené plus de cinquante expéditions dans le monde entier. Il crée alors deux associations pour organiser ces voyages et pour construire les équipements techniques spéciaux : Les Campagnes Océanographiques Françaises et le Centre d'Etudes Marines Avancées.

Symbole de l'odyssée de Cousteau à travers le monde, la Calypso mouille pour la première fois l'ancre au large de Toulon. Rachetée en 1950 par le commandant, ce bateau est totalement réaménagé en navire océanographique. Il effectue sa première expédition en mer Rouge le 24 novembre 1950.
La Calypso part de Toulon pour son premier voyage. L'équipage est composé de scientifiques qui avaient tout de suite compris l'opportunité que ce navire leur offrait. Il y a des spécialistes en biologie marine, en chimie, en géologie et en vulcanologie. Mais pour Cousteau , l'objectif crucial de cette mission est ailleurs: prouver l'efficacité des techniques de plongée. La Calypso est en fait parmi les premiers navires à faire de la science avec de petits moyens.
Ce nouveau navire de recherche scientifique est fait pour explorer et filmer les fonds marins. Le commandant Cousteau entame alors une série de campagnes de recherches qui vont en faire une légende mondiale.

Depuis le décès du commandant, en 1997, La Calypso ne cesse d'être déplacée de port en port, sans qu'aucune décision consensuelle et durable soit approuvée par les décideurs et leurs partenaires.
Actuellement, La Calypso se dégrade dans un bassin du musée maritime de La Rochelle en attendant une "éventuelle" remise en état dans les chantiers de La Ciotat...